Citotoxikus Escherichia coli törzsek és bakteriofágjaik fenotípusos és molekuláris jellemzése

Folytatódik a lezárult pályázatokban azonosított új genotípusú E. coli O157 és Shiga toxint (Stx) termelő Shigella sonnei törzsek részletes genetikai jellemzése. Tervezik továbbá haszonállatok bélmikrobiótáinak metagenomi vizsgálatát.

Témavezető: 

A korábbi Széchenyi (NKFP) és OTKA pályázatok (K37890, K81252) valamint a benyújtott NKFI pályázati tervek (K119716, K119692) alapján – többek között - tervezik újabb Shiga toxikus E. coli (STEC) O157 és nem-O157 klónok/törzsek azonosítását, genom szekvenciájuk meghatározását, a genomok annotálását, génbanki elhelyezését és az eredmények publikálását. Fontos továbbá, az izolált és az ezt követően izolálandó bakteriofágok gazdaspektrumának meghatározása és genotípusos jellemzése, a fágok evolúciós szerepének, diagnosztikai jelentőségének megismerése céljából. Tervezik új citotoxikus (citoletális duzzasztó toxin (CDT), Stx) E. coli törzsek izolálását és jellemzést szarvasmarhából. Ezeken túl tervezik egészséges és beteg baromfiból származó enterális baktérium törzs kollekció kialakítását, az izolátumok pathogenetikai és zoonotikus potenciáljának feltérképezését, valamint újonnan bevezetendő metagenomikai vizsgálatokat baromfi bél mikróbiótáján.

Shigella sonnei 75/02 Shiga toxin konvertáló bakteriofág struktúrgénjeinek kimutatása PCR-rel

1, S. sonnei lizogén; 2-4, vad típusú Shigella; 5, S. sonnei donor; 6, S. sonnei DNáz-kezelt donor; 7, E. coli K-12 (negatív kontroll); 8, DNS-mentes kontroll; M, marker

Fotó: Dr. Sváb Domonkos