Available adenovirus sequences
 
ICTV taxonomical proposals for new species: Lizard atadenovirus A, Psittacine atadenovirus A,
Penguin siadenovirus A, 9 new species in genus Mastadenovirus (green letters)
(Conditionally accepted by ICTV Executive Committee, waiting for final electronical balloting)
 
Family    Adenoviridae 
          Genus     Mastadenovirus     (only in mammals) P
          Genus     Aviadenovirus        (only in birds) P
          Genus     Atadenovirus          (in snakes, lizards, birds, ruminants, brushtail possum) P
          Genus     Siadenovirus          (in birds, frog, Sulawesi tortoise) P P
          Genus     Ichtadenovirus        (only in fish) P
          proposed genus  Testadenovirus (only in testudinoid turtles) P 

 

NEW Ballmann MZ, Harrach B (2016) Detection and partial genetic characterization of novel avi- and siadenoviruses in racing and fancy pigeons (Columba livia domestica). Acta Vet. Hung. 64 (4) 514–528 (2016) DOI: 10.1556/004.2016.047 (in press, I can send it to you until itt will be available OA)

Gilson T, Blanchette P, Ballmann MZ, Papp T, Pénzes JJ, Benkő M, Harrach B, Branton PE (2016) Using the E4orf6-based E3 ubiquitin ligase as a tool to analyze the evolution of adenoviruses. J Virol 90 (16) 7350-7367

Nguyen TH, Ballmann MZ, Do HT, Truong HN, Benkő M, Harrach B, van Raaij MJ (2016) Crystal structure of raptor adenovirus 1 fibre head and role of the beta-hairpin in siadenovirus fibre head domains. Virol J 13:106

Podgorski II, Pantó L, Papp T, Harrach B, Benkő M (2016): Genome analysis of four Old World monkey adenoviruses supports the proposed species classification of primate adenoviruses and reveals signs of possible homologous recombination. J Gen Virol Published Online: 24/03/2016 (in press) doi: 10.1099/jgv.0.000465

Vidovszky MZ, Kohl C, Boldogh S, Görföl T, Wibbelt G, Kurth A, Harrach B (2015) PCR screening of the German and Hungarian bat fauna reveals the existence of numerous hitherto unknown adenoviruses. Acta Vet Hung 63 (4) 508-525

Singh AK, Berbís MÁ, Ballmann MZ, Kilcoyne M, Menéndez M, Joshi L, Jiménez-Barbero J, Benkő M, Harrach B, van Raaij MJ (2015) Structure and sialyllactose binding of the carboxy-terminal head domain of the fibre from a siadenovirus, turkey adenovirus 3. PLoS One 10(9): e0139339 

Pantó L, Podgorski II, Jánoska M, Márkó O, Harrach B (2015) Taxonomy proposal for Old World monkey adenoviruses − characterisation of several non-human, non-ape primate adenovirus lineages. Arch Virol 160:3165-3177

Nguyen TH, Vidovszky MZ, Ballmann MZ, Sanz-Gaitero M, Singh AK, Harrach B, Benkő M, van Raaij MJ (2015) Crystal structure of the fibre head domain of bovine adenovirus 4, a ruminant atadenovirus. Virol J 12:81

Harrach B (2014) Adenoviruses: General features. In Reference Module in Biomedical Sciences. Elsevier. doi:10.1016/B978-0-12-801238-3.02523-X. (Send me the pdf)

Harrach B, Benkő M, Both GW, Brown M, Davison AJ, Echavarría M, Hess M, Jones MS, Kajon A, Lehmkuhl HD, Mautner V, Mittal SK, Wadell G (2011) 
Family Adenoviridae. King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (eds) Virus Taxonomy: Classification and Nomenclature of Viruses. 
Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Elsevier, San Diego pp 125-141 (Send me the pdf)

 

Official species names are shown in magenta and bold (the words "mastadenovirus, aviadenovirus, etc" omitted). Candidate species are in green.

The proposed new human AdV genotypes (g) are mainly recombinants (r), which are shown with their penton/hexon(loop1+loop2)/fiber characterization.

Number of fiber genes and virus associated RNAs are shown. Own publication: P; 3D structure still: 3d; movable: 3D [needs e.g., RasMol].

Further abbreviations and notes are below the table. Wikipedia links to the more exotic hosts.

 
                           panadenovirus 
                                PCR                                                             P, P P
                 P                                        <<<<P>>>     P   P                 P  P, P,     P
                                                                  3d  3d  3d                   3d 3d
                                     3D         3D                    3D  3D 3D                 3D,3D  
Mast          ITR E1a b IX IVa pol pTP VA 52 pIIIa III pVII V pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII E3  IV  E4  ITR
Bovine A    B1   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +    +   +  +  +  +   +  +   +   +   +   ++    + P
Bovine B    B3   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +    +  +  +  +   +  +   +   +   +   +   1  +    +  
Bovine C    B10  +   o  o  o  o   o   o   -  ~   ~   ^   ^   ^  ^  ^   +   +  +   +   +   +   +  1/2 +    + P P
Canine A    C1   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P
            C2   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 

 vespertilionid 4 serotine b 2 ~  ~                                                                         P

             great evening bat    ~                                                                         P

Equine A    E1   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
Equine B    E2   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 

Human A     H12  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H18  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H31  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH61 (31/61/31) +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 chimp strain ch1+   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

       Western chimp 8                                                 ~                                   

Human B     H3   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H7   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 H16 (16/4+16/16)+   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H21  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H11  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H14  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H34  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H35  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H50  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

  rH55(14/11/14) +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

  rH66 (7/7/3)   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

  rH68 (16/3/16) +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S21  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S27.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S27.2go +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S28.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S28.2go +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S29ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S32ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S33ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S35.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S35.2bo +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S41.1go +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S46go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S47go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         gorilla B7               ~   +   +  +   +   +   +   +  +  +   ~                                   

      Western lowland gorilla 2                                        ~                                   

      Western lowland gorilla 3                                        ~                                   

      mountain gorilla 4                                               ~                                   

      mountain gorilla 5                                               ~                                   

Human C     B9                                                         ^

            H1   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H1 from cat                                                ~                                    P

            H2   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H5   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H6   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

   rH57 (1/57/6) +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S31.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S34ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S40.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S42.1bo +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S43go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S44bo   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S45go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp ChAd3 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp seq13 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp seq62 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp seq63 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

      mountain gorilla 3                                               ~                                    

      mountain gorilla 6                                               ~                                   

       Eastern chimp 6                                                 ~                                   

       Eastern chimp 9                                                 ~                                     

       Western chimp 4                                                 ~                                   

Human D     H8   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H9   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H10  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H13  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H15  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H17  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H19  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H20  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H22  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H23  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H24  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H25  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H26  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H27  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H28  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
  H29 (29/15/29) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H30  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H32  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H33  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H36  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P 
            H37  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H38  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H39  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H42  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H43  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H44  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H45  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H46  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H47  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H48  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H49  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H51  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
 rH53 (37/22/8)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P 
           gH54  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 

 rH56 (9/15/9)   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH58 (58/58/29) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH59 (22/25/9)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

rH60(60/60+20/60)+   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

           gH62  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH63 (30/30/29) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH64 (22/19/37) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH65 (58/10/9)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH67 (67/9/67)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH69 (53/15/69) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

       Eastern chimp 10                                                ~                                    

Human E     H4   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S22  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S23  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S24  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S25  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S26ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S30ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S36ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

      S36 ChAd63 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S37.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S37.2bo +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S38ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S39ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     chimp ChAd6 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         chimp seq65 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     chimp Y25   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

       Eastern chimp 1                                                 ~                                    

       Eastern chimp 11                                                ~                                    

       Eastern chimp 12                                                ~                                    

       Eastern chimp 13                                                ~                                    

       Eastern chimp 14                                                ~                                    

       Weastern chimp 5                                                ~                                    

Human F     H40  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + 1 fiber/penton

            H41  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + 1 fiber/penton

       Eastern chimp 3                                                 ~                                    

       Western lowland gorilla 1                                       ~                                    

Human G     H52  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P

            S1cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P

            S2rh              ~   ~       ~          ~                 ~                                    P

            S7rh +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

            S11rh+   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P

            S12rh             ~   ^                                    ~                                    P

           S15rh o   o  o  o  ~   ~   o   o  o   o   o   o   o  o  o   ~   o  o   o   o   o   o   2  o    o P

     "rhesus 51" +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

     "rhesus 52" +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

     "rhesus 53" +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

     Macaca fascicularis 1                                             ~                                    

     rhesus 1                                                          ~                                    

Simian A    S3rh +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

            S4rh              ~   ^       ~          ~                 ~                                    P

            S6rh +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S9                ~   ~       ~          ~                 ~                                    P

            S10               ~   ~       ~          ~                 ~                                    P

            S14rh             ~   ~       ~          ~                 ~                                    P

           S48cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

       Eastern chimp 2                                                 ~                                   

Simian B    S5                ~   ~                                    ~                                    P

            S8cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P

           S49cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           S50cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

rh strains A1139 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1163 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1173 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1258 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1285 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1296 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1312 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1327 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1335 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

        baboon-1 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

     cynomolgus-1                                                       +   +  +   ~                         

Simian C   S19yb +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P

        baboon-2 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

        baboon-3 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

Simian D S13m    +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

Simian E S16gr   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P

Simian F S17gr   o   o  o  o  o   o   o   1  o   o   o   o   o  o  o   o   o  o   o   o   o   o   o  o    o

         S18gr   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Simian G S20gr   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Simian H S54rh23336+ +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Old World monkeys: cynomolgus 1                                        +   +  +   ~                         

     hamadryas baboon                                                  ~                                   

     black-and-white colobus 1                                         ~                                   

     black-and-white colobus 2                                         ~                                    

     black-and-white colobus 3                                         ~                                   

     red colobus 1                                                     ~                                   

     red colobus 2                                                     ~                                   

     red colobus 3                                                     ~                                   

New World m. cotton-top tamarin   ~                                    ~                                   

Platyrrhini A titi + + +   +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     pigmy marmoset?              ~                                                                        

Murine A    M1   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Murine B    M2   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

Murine C    M3   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

deer mouse                                                             ~                                   

Ovine A     02                                                         ~                                   

            O3   o                                                    ~ ~  +  ~                           o P

            O4                                                         ~                                   

            O5                                                         ~o                                  

            B2   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

Ovine B     01                    ^                                    ~                                   

            G2                                                         ~                                   

Porcine A   P1   +                                                                        +   +   ~       +

            P2   o                                                                        +   +   ~       o

            P3   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Porcine B   P4   o      +                                                                 +   +   +

Porcine C   P5   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Sea lion A Calif.+   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

  (South American)                                                     ~                                   

Dolphin A bottlenose +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +      

Skunk A Sk1      +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Tree shrew A TS1 +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

guinea pig  GP1                                                        ~

Ovine C     O6                    ^                                    ~                                  

squirrel    Sq1                   ~                                    ~                                    P

alpaca                            ~                                    ~                                   

Bat A bat 3      +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +  

Bat B bat 2      +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

Bat C bat WIV9   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +  +genomes WIV10, -11

bat 250-A        +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + NEW Corynorhinus rafinesquii

bat 1 (flying fox)                ~   ~                            ~ 

bats: brown long-eared bat 1      ~                                                                         P

   common noctule 2           ~   ~                                                                         P

   common noctule 3           ~   ~                                                                         P

   common pipistrelle 2           ~                                                                         P

   common pipistrelle 3       ~   ~                                                                         P

   common pipistrelle 4       ~   ~                                                                         P

   Geoffroy's bat 1           ~   ~                                                                         P

   greater horseshoe bat 1    ~   ~                                                                         P P

   greater mouse-eared bat M78-28 ~                                                                        

   greater mouse-eared bat 1  ~   ~                                                                         P

   great roundleaf bat            ~                                                                        

   grey long-eared bat        ~   ~                                                                         P P

   Horsfield's bat                ~                                                                        

   Kuhl's pipistrelle 1           ~                                                                         P

   Leschenault's Rousette fruit b.~                                    ~                                    
   lesser Asiatic yellow bat      ~                                                                         

   lesser horseshoe bat 1      ~  ~                                                                         P P

   lesser mouse-eared bat      ~  ~                                                                         P

   lesser noctule 1            ~  ~                                                                         P

   lesser noctule 2               ~                                                                         P

   lesser noctule 3               ~                                                                         P

   lesser noctule 4               ~                                                                         P

   Med. horseshoe bat 1        ~  ~                                                                         P

   Med. horseshoe bat 2           ~                                                                         P

   Mediterranean horseshoe bat 3  ~                                                                         P

   Mediterranean horseshoe bat 4  ~                                                                         P

   Nathusius' pipistrelle 1       ~                                                                         P

   northern bat 1              ~  ~                                                                         P

   parti-coloured bat          ~  ~                                                                         P

   pond bat 1                  ~  ~                                                                         P

   Rickett's big-footed bat       ~                                                                        

   Savi's pipistrelle             ~                                                                        

   serotine bat 1              ~  ~                                                                         P

   soprano pipistrelle 1       ~  ~                                                                         P

   soprano pipistrelle 2       ~  ~                                                                         P

   soprano pipistrelle 3          ~                                                                         P

   soprano pipistrelle 4          ~                                                                         P

   vespertilionid 1 c. noctule ~  ~                                                                         P

           whiskered bat          ~                                                                         P

           Nathusius' pipistrelle ~                                                                         P

   vespertilionid 2 com. pipist.  ~                                                                         P

           common noctule 1   ~   ~                                                                         P P

   vespertilionid 3 com. noctule  ~                                                                         P

             greater noctule bat  ~                                                                         P

   unknonw bat species/USA                                                            ~

rabbit                                                                 ~                                   

harbour porpoise                  ~                                                                        

 
Avi           ITR parvo-NS1 IVa pol pTP    52 pIIIa III pVII   pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII     IV ORFs ITR
                 dUTPase ORFs                                                                       
Falcon A falcon 1:
     Northern Aplomado falcon     ~                  +   +      +  +   +
     American kestrel                                                  ~  
     Orange-breasted falcon                                            ~
     Teita falcon                                                      ~
Fowl A      F1   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2  +    +     2 fibers/penton
Fowl B      F5   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P 2 fibers/penton
Fowl C      F4   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2  +    + P   2 fibers/penton 
            F10  +  +  +  +   ~   +   +              +   +      +      +          +   +   +       2  +    + P P 2 fibers/penton
Fowl D      F2   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P P 2 fibers/penton
            F3   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P P 2 fibers/penton
            F9   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    +     2 fibers/penton
            F11  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P 2 fibers/penton
Fowl E      F6   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P 2 fibers/penton
            F7   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P 2 fibers/penton
            F8a  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P   2 fibers/penton
            F8b  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P 2 fibers/penton
Goose A     Go1                                                        ^
            Go2                                                        ^

            Go4  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P

            Go5                   ~                                    ~                                    P

Turkey B    T1   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P 
Turkey C    T4   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P 
Turkey D    T5   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P 
unassigned  T2                    ^                                    ~                                    P 
Pigeon A    Pi1  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P 
unassigned  Pi2  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + in press NEW
            Pi3                   ~                                                                         in press NEW
Duck B      D2   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P 
Meyer's parrot                    ~
Psittacine  Ps1                                                        ~
gull                              +                  +                 +                                      
 
At             ITR  LH1+2   IVa pol pTP    52 pIIIa III pVII   pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII    IV E4    ITR
                   32K   LH3                                                                        RH-ORFs
Ovine D     O7   +  + ++  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + +
            G1                                                         ~
Bovine D    B4   +  + ++  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P P
            B5   +                                                     ~                                  + P
            B8                                                         ~   ^
     strain Rus  +  + ~   o   o   o   o      o   o   o    o     o  o   o   o  o   o   o   o       1  o  o + P P
Bovine E    B6   +  + ++  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P 
Bovine F    B7                    ~                                    ~   +
Duck A   D1/EDS  +  + -+  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P
Psittacine A P3  +  + -+  -   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       2  +  + +   
Lizard A Li2 Mbl +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P 1 or 3 fibers/penton
lizard 1 (gila)                   ~                                                                         P
Possum A    Po1                   ^                  +    ^            +   +                                P
Snake A     Sn1  +  +  +  +   +   +    +     +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P 
  (corn snake, boa, python)                                                                                 P 
  corn snake GER09                ~                                                                         P 
unassigned  Sn2                   ~                                                                           
            Sn4                   ~                                                                           
Cervine     Od1          ~                       ~                     ~                  ~       +
Muntjac deer                                                           ~                                      
Chameleon (mountain chameleon)    ~                                                                         P
Gecko (Eublepharid/fat-tailed g.) ~                                                                         P 
agamid (bearded dragon)           ~                                    ~                                    P
gekkonid (tokay gecko)            ~                                                                         P
scincid (blue-tongued skink)      ~                                                                         P
asp viper                         ~                                                                         P
viperid (Parias hageni)           ~                                                                           
emerald monitor (varanid)         ~                                                                         P 
anolis 1                          ~                                                                         
anolis 2                          ~                                                                         
lacertid 1                        ~                                                                         P   
lacertid 2                        ~                                                                         P   
amphisbaenian 1                   ~                  ~   +      +                                           P   
                                                                                                                                     
Si            ITR sial ORF4 IVa pol pTP    52 pIIIa III pVII   pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII E3 IV ORF7  ITR
                  hydrophobic                                                                       ORF8
Frog A   Fr1     +  +  +  -   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + P
Raptor A owl,hawk+  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + P P P P
Turkey A T3/THEV +  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + P 
Great tit A GT1                 ~    +   +      +   +   +    +     +  +   ~                                    P 
South Polar skua +  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + 
Penguin A ChP2   +  -  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + +    Chinstrap penguin                                   
Gouldian finch                    ~   +      ~                         ~                                    P 
psittacine 2                      ~ 
   (plum headed parakeet,
   umbrella cockatoo, etc.) 
Sulawesi tortoise                 ~ 
budgerigar                                                             ~
pigeon 4                          ~                                    ~                                    in press NEW
pigeon 5                          ~                                                                         in press NEW
 
Icht    
Sturgeon A  WS1  o  -  -  -   o   ~    o  -   o   o   o    o     o  o  +   +  o   o   o   -  -    -  -  - o P P 
 
Test
box turtle                        ~                                                                         
eastern box turtle                ~                                    ~                                    P
pancake tortoise                  ~                                                                         P
read-eared slider                 ~                                    ~                                    P
yellow-bellied slider             ~                                    ~                                     P
red footed tortoise 1             ~                                    ~                                    
red footed tortoise 2             ~                                                                         
 
Serotypes, even from different hosts, are grouped into species, according to calculated phylogenetic distance, 
restriction enzyme fragmentation, DNA hybridization, GC content, cross-neutralization, possibility of recombination, 
hemagglutination, and oncogenic potential. E.g., most chimpanzee AdVs and human adenovirus 4 are so similar that 
they are just different members of species Human mastadenovirus E. The serotypes often have different strains/variants,
but we do not show more than one from each serotype (from a single host).   Taxonomy          Short list
 
Signs: + full gene sequence available
       o full gene sequence not released yet
       ~ partial gene sequence available
       ^ partial gene sequence not released yet
       - corresponding gene is missing from the genome
Comment: Some genes were sequenced and submitted in multiple parts, thus they are referred
in this table with close but divided ~ ~ signs.
 
Abbreviations for host species: B: bovine, Bt: bat, C: canine, D: duck, E: equine, F: fowl,
Fr: frog, G: goat Go: goose, GP: guinea pig, H: human, M: murine, O: ovine, Od: Odocoileus (black-tailed deer), 
P: porcine, Pi: pigeon, S: simian (SAdV-1 to 20 are from old world monkeys, 21 to 25 from chimpanzee), 
Sn: Snake, Sq: squirrel, T: turkey, TS: tree shrew (tupaia), WS: white sturgeon, bo: bonobo (Pan paniscus) 
ch: chimpanzee (Pan troglodytes), cy: cynomolgus monkey (Macaca fascicularis), go: gorilla, 
gr: grivet (Chlorocebus aethiops), m: macaque sp, rh: rhesus macaque (Macaca mulatta), yb: yellow baboon (Papio cynocephalus), 
ve: vervet monkey (Chlorocebus aethiops). 
 
 
Remember: Human adenovirus 5 is not Ad5 as there are animal serotype 5 AdVs, e.g. BAdV-5, FAdV-5, OAdV-5, SAdV-5; and species 
Human mastadenovirus C is not 'adenovirus species C' as also other AdV species have C in their names (Fowl aviadenovirus C, Bovine mastadenovirus C, etc.). 
 
 
 
 
NEW 10th International Symposium on Viruses of Lower Vertebrates (ISVLV), Budapest 4-7 June 2017
 
13th International Adenovirus Meeting, Mexico, 2018 (14th, Spain, 2020)
 
12th International Adenovirus Meeting, Barsinghousen, Germany, 16-20 August 2016
 
11th International Adenovirus Meeting, San Diego, USA, 16-20 July 2014
 
10th International Adenovirus Meeting, Umea, Sweden, 13-17 June 2012
 
9th International Adenovirus Meeting, Dobogókő, Hungary, 26-30 April 2009  
     Participants    Programme   Book of Abstracts  (1.2 MB) 
 
International Workshop: Virus Infection Biology and Adenovirology, Zürich, Switzerland, 12 March 2013
 
Workshop on human adenovirus, Sapporo, Japan, 13 Sept 2011, program   (proceedings published)
 
http://www.ictvonline.org/images/ictvHeaderLogo.jpg
 
Harrach Balázs
Last update by Balazs Harrach on Dec 1, 2016

 

Thanks for the interest of our visitors: