Available adenovirus sequences
 
Important taxonomical changes: 
 
ICTV changed all species names in the family Adenoviridae 
to incorporate a genus designation e.g. Human mastadenovirus C.
(Type names, informal abbreviations did not change.)
 
 
Family    Adenoviridae 
          Genus     Mastadenovirus     (only in mammals) P
          Genus     Aviadenovirus        (only in birds) P
          Genus     Atadenovirus          (in snakes, lizards, birds, ruminants, brushtail possum) P
          Genus     Siadenovirus          (in birds, frog, Sulawesi tortoise) P P
          Genus     Ichtadenovirus        (only in fish) P
          proposed genus  Testadenovirus (only in testudinoid turtles) P 
 
Harrach B, Benkő M, Both GW, Brown M, Davison AJ, Echavarría M, Hess M, Jones MS, Kajon A, Lehmkuhl HD, Mautner V,
Mittal SK, Wadell G (2011) Family Adenoviridae. King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (eds) 
Virus Taxonomy: Classification and Nomenclature of Viruses. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. 
Elsevier, San Diego pp 125-141 (Send me the pdf)
 
Doszpoly A, Wellehan JFX, Childress AL, Tarján ZL, Kovács ER, Harrach B, Benkő M (2013) Partial characterization of a 
new adenovirus lineage discovered in testudinoid turtles. Infect Genet Evol 17:106-112 

 

Official species names are shown in magenta and bold (the words "mastadenovirus, aviadenovirus, etc" omitted).

The proposed new human AdV genotypes (g) are mainly recombinants (r), which are shown with their penton/hexon(loop1+loop2)/fiber characterization.

Number of fiber genes is shown. Own publication: P; 3D structure still: 3d; movable: 3D [needs e.g., RasMol].

Further abbreviations and notes are below the table. Wikipedia links to the more exotic hosts.

 

 
                           panadenovirus
                                PCR
                 P                                        <<<<P>>>     P   P                 P  P,P       P
                                                                  3d  3d  3d
                                     3D         3D                    3D  3D 3D                 3D,3D
Mast          ITR E1a b IX IVa pol pTP VA 52 pIIIa III pVII V pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII E3  IV  E4  ITR
Bovine A    B1   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +    +   +  +  +  +   +  +   +   +   +   ++    +  P
Bovine B    B3   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +    +  +  +  +   +  +   +   +   +   +   1  +    +
Bovine C    B10  +   o  o  o  o   o   o   -  ~   ~   ^   ^   ^  ^  ^   +   +  +   +   +   +   +  1/2 +    +  P P
Canine A    C1   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +  P
            C2   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +
Equine A    E1   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
Equine B    E2          ~     ~   ~   ~   -                        ~   +   +  ~   ~  

Human A     H12  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H18  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H31  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH61 (31/61/31) +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +  

       Western chimp 8                                                 ~                                    

Human B     H3   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H7   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

H16 (16/4+16/16) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H21  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H11  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H14  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H34  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H35  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H50  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

  rH55(14/11/14) +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

  rH66 (7/7/3)   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +       

  rH68 (16/3/16) +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +       

            S21  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S27.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S27.2go +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S28.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S28.2go +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S29ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S32ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S33ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S35.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S35.2bo +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S41.1go +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S46go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S47go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         gorilla B7               ~   +   +  +   +   +   +   +  +  +   ~                                   

      Western lowland gorilla 2                                        ~                                   

      Western lowland gorilla 3                                        ~                                   

      mountain gorilla 4                                               ~                                   

      mountain gorilla 5                                               ~                                   

Human C     B9                                                         ^

            H1   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H1 from cat                                                ~                                    P

            H2   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H5   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H6   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

   rH57 (1/57/6) +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S31.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S34ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S40.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S42.1bo +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S43go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S44bo   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S45go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp ChAd3 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp seq13 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp seq62 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp seq63 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

      mountain gorilla 3                                               ~                                    

      mountain gorilla 6                                               ~                                   

       Eastern chimp 6                                                 ~                                   

       Eastern chimp 9                                                 ~                                     

       Western chimp 4                                                 ~                                   

Human D     H8   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H9   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H10  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H13  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H15  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H17  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H19  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H20  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H22  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H23  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H24  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H25  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H26  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H27  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H28  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +
  H29 (29/15/29) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H30  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H32  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H33  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H36  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P 
            H37  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +
            H38  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H39  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H42  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H43  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H44  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H45  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H46  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +
            H47  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H48  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H49  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H51  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
 rH53 (37/22/8)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P 
           gH54  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 

 rH56 (9/15/9)   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH58 (58/58/29) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH59 (22/25/9)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

rH60(60/60+20/60)+   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

           gH62  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH63 (30/30/29) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH64 (22/19/37) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH65 (58/10/9)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH67 (67/9/67)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

       Eastern chimp 10                                                ~                                    

Human E     H4   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S22  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S23  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S24  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S25  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S26ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S30ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S36ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

      S36 ChAd63 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S37.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S37.2bo +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S38ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S39ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     chimp ChAd6 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         chimp seq65 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     chimp Y25   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

       Eastern chimp 1                                                 ~                                    

       Eastern chimp 11                                                ~                                    

       Eastern chimp 12                                                ~                                    

       Eastern chimp 13                                                ~                                    

       Eastern chimp 14                                                ~                                    

       Weastern chimp 5                                                ~                                    

Human F     H40  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

            H41  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

       Eastern chimp 3                                                 ~                                    

       Western lowland gorilla 1                                       ~                                    

Human G     H52  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P

            S1cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P

            S2rh                  ^       ~ 

            S7rh +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

            S11rh                 ^       ~

            S12rh                 ^

           S15rh o   o  o  o  o   o   o   o  o   o    o   o  o  o  o   o   o  o   o   o   o   o   2  o    o

     Macaca fascicularis 1                                             ~                                    

     rhesus 1                                                          ~                                    

Simian A    S3rh +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

            S4rh                  ^       ~

            S6rh +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S9                    ^       ~

            S10                   ^       ~

            S14rh                 ^       ~

           S48cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

       Eastern chimp 2                                                 ~                                   

Simian B    S5                    ^

            S8cy +                ~                                                                       +

           S49cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           S50cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

 rh strain A1139 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1163 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1173 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1258 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1285 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1296 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1312 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1327 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1335 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

        baboon-1 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

Simian C   S19yb                  ^       +

        baboon-2 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

        baboon-3 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

unassigned SAdVs S13              ^       ~

           S16ve +   +  ~  ~      ^   ~   +  ~

           S17gr                  ^

           S18gr +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

           S20gr +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     cynomolgus 1                                                      +   +  +   ~                         

     Titi monkey +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

     black-and-white colobus 1                                         ~                                   

     black-and-white colobus 2                                         ~                                    

     black-and-white colobus 3                                         ~                                   

     red colobus 1                                                     ~                                   

     red colobus 2                                                     ~                                   

     red colobus 3                                                     ~                                   

     hamadryas baboon                                                  ~                                   

     pigmy marmoset?              ~                                                                        

     cotton-top tamarin           ~                                    ~                                   

Murine A    M1   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Murine B    M2   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

Murine C    M3   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

deer mouse                                                             ~                                   

Ovine A     02                                                         ~                                 

            O3   o                                                    ~ ~  +  ~                           o P

            O4                                                         ~                                  

            O5                                                         ~o                                

            B2   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

Ovine B     01                    ^                                    ~                                 

            G2                                                         ~                                  

Porcine A   P1   +                                                                        +   +   ~       +

            P2   o                                                                        +   +   ~       o

            P3   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Porcine B   P4   o      +                                                                 +   +   +

Porcine C   P5   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Tree shrew A TS1 +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

guinea pig  GP1                                                        ~

Ovine C     O6                    ^                                    ~                                 

squirrel    Sq1                   ~                                    ~                                    P

alpaca                            ~                                    ~                                   

Bat A bat 3          +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +

Bat B bat 2      +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

bat 1 (flying fox)                ~   ~                            ~ 

bats: common noctule              ~                                                                         P

      greater horseshoe bat       ~                                                                         P

      lesser horseshoe bat        ~                                                                         P 

      grey long-eared bat         ~                                                                         P

      greater mouse-eared bat     ~

      lesser Asiatic yellow bat   ~                                                                         

      Rickett's big-footed bat    ~                                                                         

      great roundleaf bat         ~                                                                         

      Horsfield's bat             ~                                                                        

 Leschenault's Rousette fruit bat ~                                    ~                                   

      unknonw bat species/USA                                                            ~

      greater noctule bat         ~                                                                         

      lesser noctule              ~                                                                         

      Savi's pipistrelle          ~                                                                         

rabbit                                                                 ~                                   

sea lion (Californian)            ~                                                                          

         (South American)                                              ~                                

harbour porpoise                  ~                                                                        

 
Avi           ITR parvo-NS1 IVa pol pTP    52 pIIIa III pVII   pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII     IV ORFs ITR
                 dUTPase ORFs                                                                       
Falcon A falcon 1:
     Northern Aplomado falcon     ~                  +   +      +  +   +
     American kestrel                                                  ~  
     Orange-breasted falcon                                            ~
     Teita falcon                                                      ~
Fowl A      F1   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2  +    +
Fowl B      F5   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P 
     strain 8844                                                       ~                                    P 
Fowl C      F4   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2  +    + P 
            F10  +  +  +  +   ~   ~   +              +   +      +      +          +   +   +       2  +    + P 
Fowl D      F2   +  +  +  +   +   ~                                    ~                             +    + P P 
            F3                    ~                                    ~                                    P P
            F9   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    +
            F11                   ~                                    ~                                    P 
Fowl E      F6                    ~                                    ~                                    P 
            F7                    ~                                    ~                                    P 
            F8   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    +        
              F8a                 ~                                    ~          ~   +   +       1  +    + P 
              F8b                 ~                                    ~                                    P 
Goose A     Go1                                                        ^
            Go2                                                        ^
     Go3 (Does anybody have it?)                                                       

            Go4  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P

            Go5                   ~                                    ~                                    P

Turkey B    T1   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P 
Turkey C    T4   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P 
Turkey D    T5   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P 
unassigned  T2                    ^                                    ~                                    P 
Pigeon A    Pi1  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P NEW
unassigned  Pi2                   ^
Duck B      D2   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P NEW
 
Meyer's parrot                    ~
Psittacine  Ps1                                                        ~
gull                              +                  +                 +                                      
 
At             ITR  LH1+2   IVa pol pTP    52 pIIIa III pVII   pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII    IV E4    ITR
                   32K   LH3                                                                        RH-ORFs
Ovine D     O7   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + +
            G1                                                         ~
Duck A   D1/EDS  +  +  +  -   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P
Bovine D    B4   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P
            B5   +                                                     ~                                  + P
            B8                                                         ~   ^
     strain Rus  +  +  ~  o   o   o   o      o   o   o    o     o  o   o   o  o   o   o   o       1  o  o + P P
Bovine E    B6   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P 
Bovine F    B7                    ~                                    ~   +
Possum A    Po1                   ^                  +    ^            +   +                                P
Snake A     Sn1  +  +  +  +   +   +    +     +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P 
  (corn snake, boa, python)                                                                                 P 
  corn snake GER09                ~                                                                         P 
unassigned  Sn2                   ~                                                                           
            Sn4                   ~                                                                           
Cervine     Od1          ~                       ~                     ~                  ~       +
Chameleon (mountain chameleon)    ~                                                                         P
Gecko (Eublepharid, Ge1)          ~                                                                         P
       (fat-tailed gecko)
agamid (bearded dragon)           ~                                    ~                                    P
gekkonid (tokay gecko)            ~                                                                         P
lizard 1 (gila)                   ~                                                                         P
lizard 2 M.b.l.  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P NEW 
scincid (blue-tongued skink)      ~                                                                         P
asp viper                         ~                                                                         P
viperid (Parias hageni)           ~                                                                           
emerald monitor (varanid)         ~                                                                         P 
anolis 1                          ~                                                                         
anolis 2                          ~                                                                         
                                                                                                                                        
Si            ITR sial ORF4 IVa pol pTP    52 pIIIa III pVII   pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII E3 IV ORF7  ITR
                  hydrophobic                                                                       ORF8
Frog A   Fr1     +  +  +  -   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + P
Raptor A owl,hawk+  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + P P P 
Turkey A T3/THEV +  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + +
         MSDV                                                          ^   o  ^           o
Great tit A GT1                 ~    +   +      +   +   +    +     +  +   ~                                    P 
South Polar skua +  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + 
psittacine 2                      ~ 
   (plum headed parakeet,
   umbrella cockatoo, etc.) 
Sulawesi tortoise                 ~ 
Gouldian finch                    ~   +      ~                         ~                                    P NEW
budgerigar                                                             ~                                     
 
Icht    
Sturgeon A  WS1  o  -  -  -   o   ~    o  -   o   o   o    o     o  o  +   +  o   o   o   -  -    -  -  - o P P 
 
Test
box turtle                        ~                                                                         
eastern box turtle                ~                                    ~                                    P
pancake tortoise                  ~                                                                         P
read-eared slider                 ~                                    ~                                    P
yellow-bellied slider             ~                                    ~                                     P
 
 
Serotypes, even from different hosts, are grouped into species, according to calculated phylogenetic distance, 
restriction enzyme fragmentation, DNA hybridization, GC content, cross-neutralization, possibility of recombination, 
hemagglutination, and oncogenic potential. E.g., most chimpanzee AdVs and human adenovirus 4 are so similar that 
they are just different members of species Human mastadenovirus E. The serotypes often have different strains/variants,
but we do not show more than one from each serotype (from a single host).   Taxonomy          Short list
 
Signs: + full gene sequence available
       o full gene sequence not released yet
       ~ partial gene sequence available
       ^ partial gene sequence not released yet
       - corresponding gene is missing from the genome
Comment: Some genes were sequenced and submitted in multiple parts, thus they are referred
in this table with close but divided ~ ~ signs.
 
Abbreviations for host species: B: bovine, Bt: bat, C: canine, D: duck, E: equine, F: fowl,
Fr: frog, G: goat Go: goose, GP: guinea pig, H: human, M: murine, O: ovine, Od: Odocoileus (black-tailed deer), 
P: porcine, Pi: pigeon, S: simian (SAdV-1 to 20 are from old world monkeys, 21 to 25 from chimpanzee), 
Sn: Snake, Sq: squirrel, T: turkey, TS: tree shrew (tupaia), WS: white sturgeon, bo: bonobo (Pan paniscus) 
ch: chimpanzee (Pan troglodytes), cy: cynomolgus monkey (Macaca fascicularis), go: gorilla, 
gr: grivet (Chlorocebus aethiops), rh: rhesus macaque (Macaca mulatta), yb: yellow baboon (Papio cynocephalus), 
ve: vervet monkey (Chlorocebus aethiops). 
 
 
Remember: Human adenovirus 5 is not Ad5 as there are animal serotype 5 AdVs, e.g. BAdV-5, FAdV-5, OAdV-5, SAdV-5; and species 
Human mastadenovirus C is not 'adenovirus species C' as also other AdV species have C in their names (Fowl aviadenovirus C, Bovine mastadenovirus C, etc.). 
 
 
 
 
11th International Adenovirus Meeting, San Diego, USA, 16-20 July 2014
 
10th International Adenovirus Meeting, Umea, Sweden, 13-17 June 2012
 
9th International Adenovirus Meeting, Dobogókő, Hungary, 26-30 April 2009  
     Participants    Programme   Book of Abstracts  (1.2 MB) 
 
International Workshop: Virus Infection Biology and Adenovirology, Zürich, Switzerland, 12 March 2013  
 
Workshop on human adenovirus, Sapporo, Japan, 13 Sept 2011, program   (proceedings published)
 
http://www.ictvonline.org/images/ictvHeaderLogo.jpg
 
Harrach Balázs
Last update by Balazs Harrach on Aug 15, 2014. 

 

Thanks for the interest of our visitors: