Available adenovirus sequences
 
NEWS: ICTV officially accepted six novel species on April 29, 2016: Simian mastadenovirus B, 
Simian mastadenovirus C, Duck aviadenovirus A, Pigeon aviadenovirus A, Turkey aviadenovirus C, 
Turkey aviadenovirus D. (Deadline for the next taxonomical proposals: July 18,2016: 
benko@vmri.hu and harrach@vmri.hu, https://talk.ictvonline.org/files/taxonomy-proposal-templates/.) 
 
Family    Adenoviridae 
          Genus     Mastadenovirus     (only in mammals) P
          Genus     Aviadenovirus        (only in birds) P
          Genus     Atadenovirus          (in snakes, lizards, birds, ruminants, brushtail possum) P
          Genus     Siadenovirus          (in birds, frog, Sulawesi tortoise) P P
          Genus     Ichtadenovirus        (only in fish) P
          proposed genus  Testadenovirus (only in testudinoid turtles) P 

 

NEW Gilson T, Blanchette P, Ballmann MZ, Papp T, Pénzes JJ, Benkő M, Harrach B, Branton PE (2016) Using the E4orf6-based E3 ubiquitin ligase as a tool to analyze the evolution of adenoviruses. J Virol [Epub ahead of print]

NEW Nguyen TH, Ballmann MZ, Do HT, Truong HN, Benkő M, Harrach B, van Raaij MJ (2016) Crystal structure of raptor adenovirus 1 fibre head and role of the beta-hairpin in siadenovirus fibre head domains. Virol J.

Podgorski II, Pantó L, Papp T, Harrach B, Benkő M (2016): Genome analysis of four Old World monkey adenoviruses supports the proposed species classification of primate adenoviruses and reveals signs of possible homologous recombination. J Gen Virol Published Online: 24/03/2016 (in press) doi: 10.1099/jgv.0.000465

Vidovszky MZ, Kohl C, Boldogh S, Görföl T, Wibbelt G, Kurth A, Harrach B (2015) PCR screening of the German and Hungarian bat fauna reveals the existence of numerous hitherto unknown adenoviruses. Acta Vet Hung 63 (4) 508-525

Singh AK, Berbís MÁ, Ballmann MZ, Kilcoyne M, Menéndez M, Joshi L, Jiménez-Barbero J, Benkő M, Harrach B, van Raaij MJ (2015) Structure and sialyllactose binding of the carboxy-terminal head domain of the fibre from a siadenovirus, turkey adenovirus 3. PLoS One 10(9): e0139339 

Pantó L, Podgorski II, Jánoska M, Márkó O, Harrach B (2015) Taxonomy proposal for Old World monkey adenoviruses − characterisation of several non-human, non-ape primate adenovirus lineages. Arch Virol 160:3165-3177

Nguyen TH, Vidovszky MZ, Ballmann MZ, Sanz-Gaitero M, Singh AK, Harrach B, Benkő M, van Raaij MJ (2015) Crystal structure of the fibre head domain of bovine adenovirus 4, a ruminant atadenovirus. Virol J 12:81

Harrach B (2014) Adenoviruses: General features. In Reference Module in Biomedical Sciences. Elsevier. doi:10.1016/B978-0-12-801238-3.02523-X. (Send me the pdf)

Harrach B, Benkő M, Both GW, Brown M, Davison AJ, Echavarría M, Hess M, Jones MS, Kajon A, Lehmkuhl HD, Mautner V, Mittal SK, Wadell G (2011) 
Family Adenoviridae. King AMQ, Adams MJ, Carstens EB, Lefkowitz EJ (eds) Virus Taxonomy: Classification and Nomenclature of Viruses. 
Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Elsevier, San Diego pp 125-141 (Send me the pdf)

 

Official species names are shown in magenta and bold (the words "mastadenovirus, aviadenovirus, etc" omitted). Candidate species are in green.

The proposed new human AdV genotypes (g) are mainly recombinants (r), which are shown with their penton/hexon(loop1+loop2)/fiber characterization.

Number of fiber genes and virus associated RNAs are shown. Own publication: P; 3D structure still: 3d; movable: 3D [needs e.g., RasMol].

Further abbreviations and notes are below the table. Wikipedia links to the more exotic hosts.

 
                           panadenovirus 
                                PCR                                                             P, PNEW PNEW
                 P                                        <<<<P>>>     P   P                 P  P, P,     P
                                                                  3d  3d  3d                   3d 3dNEW
                                     3D         3D                    3D  3D 3D                 3D,3D  
Mast          ITR E1a b IX IVa pol pTP VA 52 pIIIa III pVII V pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII E3  IV  E4  ITR
Bovine A    B1   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +    +   +  +  +  +   +  +   +   +   +   ++    + P
Bovine B    B3   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +    +  +  +  +   +  +   +   +   +   +   1  +    +  
Bovine C    B10  +   o  o  o  o   o   o   -  ~   ~   ^   ^   ^  ^  ^   +   +  +   +   +   +   +  1/2 +    + P P
Canine A    C1   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P
            C2   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 

 vespertilionid 4 serotine b 2 ~  ~                                                                         P NEW

             great evening bat    ~                                                                         P NEW

Equine A    E1   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
Equine B    E2   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + NEWEST

Human A     H12  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H18  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H31  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH61 (31/61/31) +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 chimp strain ch1+   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

       Western chimp 8                                                 ~                                   

Human B     H3   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H7   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 H16 (16/4+16/16)+   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H21  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H11  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H14  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H34  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H35  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H50  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

  rH55(14/11/14) +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

  rH66 (7/7/3)   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

  rH68 (16/3/16) +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S21  +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S27.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S27.2go +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S28.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S28.2go +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S29ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S32ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S33ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S35.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S35.2bo +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S41.1go +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S46go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S47go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         gorilla B7               ~   +   +  +   +   +   +   +  +  +   ~                                   

      Western lowland gorilla 2                                        ~                                   

      Western lowland gorilla 3                                        ~                                   

      mountain gorilla 4                                               ~                                   

      mountain gorilla 5                                               ~                                   

Human C     B9                                                         ^

            H1   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H1 from cat                                                ~                                    P

            H2   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H5   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H6   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

   rH57 (1/57/6) +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S31.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S34ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S40.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S42.1bo +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S43go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S44bo   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S45go   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp ChAd3 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp seq13 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp seq62 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     Chimp seq63 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

      mountain gorilla 3                                               ~                                    

      mountain gorilla 6                                               ~                                   

       Eastern chimp 6                                                 ~                                   

       Eastern chimp 9                                                 ~                                     

       Western chimp 4                                                 ~                                   

Human D     H8   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H9   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H10  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H13  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H15  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H17  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H19  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H20  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H22  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            H23  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H24  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H25  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H26  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H27  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H28  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
  H29 (29/15/29) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H30  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H32  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H33  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H36  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P 
            H37  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H38  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H39  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H42  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H43  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H44  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H45  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H46  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H47  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H48  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H49  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
            H51  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 
 rH53 (37/22/8)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P 
           gH54  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + 

 rH56 (9/15/9)   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH58 (58/58/29) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH59 (22/25/9)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

rH60(60/60+20/60)+   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

           gH62  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH63 (30/30/29) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH64 (22/19/37) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH65 (58/10/9)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH67 (67/9/67)  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

 rH69 (53/15/69) +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

       Eastern chimp 10                                                ~                                    

Human E     H4   +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S22  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S23  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S24  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S25  +   +  +  +  +   +   +   2  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S26ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S30ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S36ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

      S36 ChAd63 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S37.1ch +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S37.2bo +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S38ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         S39ch   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     chimp ChAd6 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         chimp seq65 +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     chimp Y25   +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

       Eastern chimp 1                                                 ~                                    

       Eastern chimp 11                                                ~                                    

       Eastern chimp 12                                                ~                                    

       Eastern chimp 13                                                ~                                    

       Eastern chimp 14                                                ~                                    

       Weastern chimp 5                                                ~                                    

Human F     H40  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + 1 fiber/penton

            H41  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + 1 fiber/penton

       Eastern chimp 3                                                 ~                                    

       Western lowland gorilla 1                                       ~                                    

Human G     H52  +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P

            S1cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P

            S2rh              ~   ~       ~          ~                 ~                                    P NEW

            S7rh +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

            S11rh+   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P NEW

            S12rh             ~   ^                                    ~                                    P NEW

           S15rh o   o  o  o  ~   ~   o   o  o   o   o   o   o  o  o   ~   o  o   o   o   o   o   2  o    o P NEW

     "rhesus 51" +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

     "rhesus 52" +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

     "rhesus 53" +   +  +  +  +   +   +   +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

     Macaca fascicularis 1                                             ~                                    

     rhesus 1                                                          ~                                    

Simian A    S3rh +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

            S4rh              ~   ^       ~          ~                 ~                                    P NEW

            S6rh +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

            S9                ~   ~       ~          ~                 ~                                    P NEW

            S10               ~   ~       ~          ~                 ~                                    P NEW

            S14rh             ~   ~       ~          ~                 ~                                    P NEW

           S48cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

       Eastern chimp 2                                                 ~                                   

Simian B    S5                ~   ~                                    ~                                    P NEW

            S8cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P NEW

           S49cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           S50cy +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

rh strains A1139 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1163 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1173 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1258 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1285 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1296 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1312 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1327 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

           A1335 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

        baboon-1 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

     cynomolgus-1                                                       +   +  +   ~                         

Simian C   S19yb +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P NEW

        baboon-2 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

        baboon-3 +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    +

Simian D S13m    +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P NEW

Simian E S16gr   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   2  +    + P NEW

Simian F S17gr   o   o  o  o  o   o   o   1  o   o   o   o   o  o  o   o   o  o   o   o   o   o   o  o    o

         S18gr   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Simian G S20gr   +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Simian H S54rh23336+ +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Old World monkeys cynomolgus 1                                         +   +  +   ~                         

     hamadryas baboon                                                  ~                                   

     black-and-white colobus 1                                         ~                                   

     black-and-white colobus 2                                         ~                                    

     black-and-white colobus 3                                         ~                                   

     red colobus 1                                                     ~                                   

     red colobus 2                                                     ~                                   

     red colobus 3                                                     ~                                   

NWM Titi monkey +   +  +   +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

     pigmy marmoset?              ~                                                                        

     cotton-top tamarin           ~                                    ~                                   

Murine A    M1   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Murine B    M2   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

Murine C    M3   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

deer mouse                                                             ~                                   

Ovine A     02                                                         ~                                   

            O3   o                                                    ~ ~  +  ~                           o P

            O4                                                         ~                                   

            O5                                                         ~o                                  

            B2   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

Ovine B     01                    ^                                    ~                                   

            G2                                                         ~                                   

Porcine A   P1   +                                                                        +   +   ~       +

            P2   o                                                                        +   +   ~       o

            P3   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Porcine B   P4   o      +                                                                 +   +   +

Porcine C   P5   +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

Tree shrew A TS1 +   +  +  +  +   +   +   -  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

guinea pig  GP1                                                        ~

Ovine C     O6                    ^                                    ~                                  

squirrel    Sq1                   ~                                    ~                                    P

alpaca                            ~                                    ~                                   

Bat A bat 3      +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + updated

Bat B bat 2      +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + P

bat 1 (flying fox)                ~   ~                            ~ 

    bat WIV9     +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + NEW 

    bat WIV10    +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + NEW 

    bat WIV11    +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    + NEW 

bats: brown long-eared bat 1      ~                                                                         P NEW

   common noctule 2           ~   ~                                                                         P NEW

   common noctule 3           ~   ~                                                                         P NEW

   common pipistrelle 2           ~                                                                         P NEW

   common pipistrelle 3       ~   ~                                                                         P NEW

   common pipistrelle 4       ~   ~                                                                         P NEW

   Geoffroy's bat 1           ~   ~                                                                         P NEW

   greater horseshoe bat 1    ~   ~                                                                         P P NEW

   greater mouse-eared bat M78-28 ~                                                                        

   greater mouse-eared bat 1  ~   ~                                                                         P NEW

   great roundleaf bat            ~                                                                        

   grey long-eared bat        ~   ~                                                                         P P NEW

   Horsfield's bat                ~                                                                        

   Kuhl's pipistrelle 1           ~                                                                         P NEW

   Leschenault's Rousette fruit b.~                                    ~                                    
   lesser Asiatic yellow bat      ~                                                                         

   lesser horseshoe bat 1      ~  ~                                                                         P P NEW

   lesser mouse-eared bat      ~  ~                                                                         P NEW

   lesser noctule 1            ~  ~                                                                         P NEW

   lesser noctule 2               ~                                                                         P NEW

   lesser noctule 3               ~                                                                         P NEW

   lesser noctule 4               ~                                                                         P NEW

   Med. horseshoe bat 1        ~  ~                                                                         P NEW

   Med. horseshoe bat 2           ~                                                                         P NEW~

   Mediterranean horseshoe bat 3  ~                                                                         P NEW

   Mediterranean horseshoe bat 4  ~                                                                         P NEW

   Nathusius' pipistrelle 1       ~                                                                         P NEW

   northern bat 1              ~  ~                                                                         P NEW

   parti-coloured bat          ~  ~                                                                         P NEW

   pond bat 1                  ~  ~                                                                         P NEW

   Rickett's big-footed bat       ~                                                                        

   Savi's pipistrelle             ~                                                                        

   serotine bat 1              ~  ~                                                                         P NEW

   soprano pipistrelle 1       ~  ~                                                                         P NEW

   soprano pipistrelle 2       ~  ~                                                                         P NEW

   soprano pipistrelle 3          ~                                                                         P NEW

   soprano pipistrelle 4          ~                                                                         P NEW

   vespertilionid 1 c. noctule ~  ~                                                                         P NEW

           whiskered bat          ~                                                                         P NEW

           Nathusius' pipistrelle ~                                                                         P NEW

   vespertilionid 2 com. pipist.  ~                                                                         P NEW

           common noctule 1   ~   ~                                                                         P P NEW

   vespertilionid 3 com. noctule  ~                                                                         P NEW

             greater noctule bat  ~                                                                         P NEW

   unknonw bat species/USA                                                            ~

skunk            +   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

rabbit                                                                 ~                                   

sea lion (Calif.)+   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +    +

         (South American)                                              ~                                   

harbour porpoise                  ~                                                                        

bottlenose dolphin   +  +  +  +   +   +   1  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +   +   +   +   1  +      
 
Avi           ITR parvo-NS1 IVa pol pTP    52 pIIIa III pVII   pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII     IV ORFs ITR
                 dUTPase ORFs                                                                       
Falcon A falcon 1:
     Northern Aplomado falcon     ~                  +   +      +  +   +
     American kestrel                                                  ~  
     Orange-breasted falcon                                            ~
     Teita falcon                                                      ~
Fowl A      F1   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2  +    +     2 fibers/penton
Fowl B      F5   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P 2 fibers/penton
Fowl C      F4   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2  +    + P   2 fibers/penton 
            F10  +  +  +  +   ~   +   +              +   +      +      +          +   +   +       2  +    + P P NEWEST 2 fibers/penton
Fowl D      F2   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P P NEWEST 2 fibers/penton
            F3   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P P NEWEST 2 fibers/penton
            F9   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    +     2 fibers/penton
            F11  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P NEWEST 2 fibers/penton
Fowl E      F6   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P NEWEST 2 fibers/penton
            F7   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P NEWEST 2 fibers/penton
            F8a  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P   NEWEST 2 fibers/penton
            F8b  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P P NEWEST 2 fibers/penton
Goose A     Go1                                                        ^
            Go2                                                        ^

            Go4  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P

            Go5                   ~                                    ~                                    P

Turkey B    T1   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P 
Turkey C    T4   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P 
Turkey D    T5   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P 
unassigned  T2                    ^                                    ~                                    P 
Pigeon A    Pi1  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P 
unassigned  Pi2                   ^
Duck B      D2   +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       1  +    + P 
Meyer's parrot                    ~
Psittacine  Ps1                                                        ~
gull                              +                  +                 +                                      
 
At             ITR  LH1+2   IVa pol pTP    52 pIIIa III pVII   pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII    IV E4    ITR
                   32K   LH3                                                                        RH-ORFs
Ovine D     O7   +  + ++  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + +
            G1                                                         ~
Bovine D    B4   +  + ++  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P P
            B5   +                                                     ~                                  + P
            B8                                                         ~   ^
     strain Rus  +  + ~   o   o   o   o      o   o   o    o     o  o   o   o  o   o   o   o       1  o  o + P P
Bovine E    B6   +  + ++  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P 
Bovine F    B7                    ~                                    ~   +
Duck A   D1/EDS  +  + -+  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P
psittacine 3     +  + -+  -   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       2  +  + +   
Possum A    Po1                   ^                  +    ^            +   +                                P
Snake A     Sn1  +  +  +  +   +   +    +     +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +       1  +  + + P 
  (corn snake, boa, python)                                                                                 P 
  corn snake GER09                ~                                                                         P 
unassigned  Sn2                   ~                                                                           
            Sn4                   ~                                                                           
Cervine     Od1          ~                       ~                     ~                  ~       +
Muntjac deer                                                           ~                                      
Chameleon (mountain chameleon)    ~                                                                         P
Gecko (Eublepharid, Ge1)          ~                                                                         P
       (fat-tailed gecko)
agamid (bearded dragon)           ~                                    ~                                    P
gekkonid (tokay gecko)            ~                                                                         P
lizard 1 (gila)                   ~                                                                         P
lizard 2 M.b.l.  +  +  +  +   +   +   +      +   +   +   +      +  +   +   +  +   +   +   +       2   +   + P 1 or 3 fibers/penton
scincid (blue-tongued skink)      ~                                                                         P
asp viper                         ~                                                                         P
viperid (Parias hageni)           ~                                                                           
emerald monitor (varanid)         ~                                                                         P 
anolis 1                          ~                                                                         
anolis 2                          ~                                                                         
                                                                                                                                        
Si            ITR sial ORF4 IVa pol pTP    52 pIIIa III pVII   pX pVI II 23 DBP 100 33 pVIII E3 IV ORF7  ITR
                  hydrophobic                                                                       ORF8
Frog A   Fr1     +  +  +  -   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + P
Raptor A owl,hawk+  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + P P P P
Turkey A T3/THEV +  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + P 
         MSDV                                                          ^   o  ^           o
Great tit A GT1                 ~    +   +      +   +   +    +     +  +   ~                                    P 
South Polar skua +  +  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + 
psittacine 2                      ~ 
   (plum headed parakeet,
   umbrella cockatoo, etc.) 
Sulawesi tortoise                 ~ 
Gouldian finch                    ~   +      ~                         ~                                    P 
budgerigar                                                             ~                                     
Chinstrap penguin + -  +  +   +   +   +      +   +   +    +     +  +   +   +  +   +   +   +  +    1  +  + + NEWEST                                                     ~                                      
 
Icht    
Sturgeon A  WS1  o  -  -  -   o   ~    o  -   o   o   o    o     o  o  +   +  o   o   o   -  -    -  -  - o P P 
 
Test
box turtle                        ~                                                                         
eastern box turtle                ~                                    ~                                    P
pancake tortoise                  ~                                                                         P
read-eared slider                 ~                                    ~                                    P
yellow-bellied slider             ~                                    ~                                     P
 
 
Serotypes, even from different hosts, are grouped into species, according to calculated phylogenetic distance, 
restriction enzyme fragmentation, DNA hybridization, GC content, cross-neutralization, possibility of recombination, 
hemagglutination, and oncogenic potential. E.g., most chimpanzee AdVs and human adenovirus 4 are so similar that 
they are just different members of species Human mastadenovirus E. The serotypes often have different strains/variants,
but we do not show more than one from each serotype (from a single host).   Taxonomy          Short list
 
Signs: + full gene sequence available
       o full gene sequence not released yet
       ~ partial gene sequence available
       ^ partial gene sequence not released yet
       - corresponding gene is missing from the genome
Comment: Some genes were sequenced and submitted in multiple parts, thus they are referred
in this table with close but divided ~ ~ signs.
 
Abbreviations for host species: B: bovine, Bt: bat, C: canine, D: duck, E: equine, F: fowl,
Fr: frog, G: goat Go: goose, GP: guinea pig, H: human, M: murine, O: ovine, Od: Odocoileus (black-tailed deer), 
P: porcine, Pi: pigeon, S: simian (SAdV-1 to 20 are from old world monkeys, 21 to 25 from chimpanzee), 
Sn: Snake, Sq: squirrel, T: turkey, TS: tree shrew (tupaia), WS: white sturgeon, bo: bonobo (Pan paniscus) 
ch: chimpanzee (Pan troglodytes), cy: cynomolgus monkey (Macaca fascicularis), go: gorilla, 
gr: grivet (Chlorocebus aethiops), m: macaque sp, rh: rhesus macaque (Macaca mulatta), yb: yellow baboon (Papio cynocephalus), 
ve: vervet monkey (Chlorocebus aethiops). 
 
 
Remember: Human adenovirus 5 is not Ad5 as there are animal serotype 5 AdVs, e.g. BAdV-5, FAdV-5, OAdV-5, SAdV-5; and species 
Human mastadenovirus C is not 'adenovirus species C' as also other AdV species have C in their names (Fowl aviadenovirus C, Bovine mastadenovirus C, etc.). 
 
 
 
 
12th International Adenovirus Meeting, Barsinghousen, Germany, 16-20 August 2016
 
11th International Adenovirus Meeting, San Diego, USA, 16-20 July 2014
 
10th International Adenovirus Meeting, Umea, Sweden, 13-17 June 2012
 
9th International Adenovirus Meeting, Dobogókő, Hungary, 26-30 April 2009  
     Participants    Programme   Book of Abstracts  (1.2 MB) 
 
International Workshop: Virus Infection Biology and Adenovirology, Zürich, Switzerland, 12 March 2013
 
Workshop on human adenovirus, Sapporo, Japan, 13 Sept 2011, program   (proceedings published)
 
http://www.ictvonline.org/images/ictvHeaderLogo.jpg
 
Harrach Balázs
Last update by Balazs Harrach on July 7, 2016. 

 

Thanks for the interest of our visitors: